亥客書院逐步規劃多門課程。課程規劃主要分為以下三類：
- 基礎課程：適合一般開發人員或網管
- 基本軟體工程
- 程式安全：偏重如何撰寫安全程式
- 系統安全
- 軟體除錯
- 軟體測試
- 密碼學
- 網路攻防
- 實務課程：適合企業資安工作人員
- 企業滲透測試
- 企業資安事件應變
- 專業課程：適合資深資安研究員
- 漏洞研究
- 惡意程式分析
交通大學亥客書院開放式課程一覽表
| 課程類別 | 課號 | 課程名稱 | 適合人員 |
| 資安基礎實務課程 | B001 | 因應攻擊之防禦策略與應變處理 | 資訊主管、資安決策人員、政策制定人員 |
| B002 | 基本軟體工程 | 軟體開發人員 | |
| B003 | 基礎程式安全 | 軟體開發人員 | |
| B004 | 基礎系統安全 | 軟體開發人員 | |
| B005 | Metasploit:基礎系統滲透測試 | 網管人員、資安人員 | |
| B006 | 軟體開發流程與版本控制 | 軟體開發人員、專案管理人員 | |
| B007 | 基礎資安攻防 | 軟體開發人員、網站開發人員 | |
| B008 | 如何撰寫安全程式－從攻防的角度看程式漏洞 | 程式開發人員、系統管理人員、資安工程師 | |
| B009 | Windows系統安全實務 | 軟體開發人員、網站開發人員 | |
| B010 | Linux系統管理 | 網管人員 | |
| B011 | Windows系統管理 | 網管人員 | |
| B012 | 網路管理 | 網管人員、網站開發人員、資安鑑識人員 | |
| B013 | 資安系統建置及運作 | 網管人員、資安鑑識人員 | |
| B014 | 防火牆與入侵偵測 | 網管人員、資安人員 | |
| B015 | 惡意程式檢測 | 系統管理人員、資安工程師、資安鑑識人員 | |
| B016 | 網路攻防 | 網管人員、滲透測試人員 | |
| B017 | 基礎網站安全建構實務 | 資安人員、網管人員、網頁開發人員 | |
| B018 | 密碼系統之漏洞、修補與檢測 | 網管人員、系統管理人員、資安人員 | |
| B019 | 安全通訊協定 | 網站開發人員 | |
| B020 | 第三方支付 | 社會人士企業決策 | |
| B021 | 4G行動網路安全之潛在風險與檢測 | 4G設備開發人員、4G網路網管人員 | |
| B022 | 基礎網頁安全與滲透測試 | 網管人員、網頁開發人員 | |
| B023 | DDos原理與實務 | 網管人員、系統管理人員、資安人員 | |
| 資安進階實務課程 | A001 | 軟體脅迫、測試與除錯 | 軟體開發人員、軟體測試人員 |
| A002 | 深度弱點掃描實務 | 網管人員 | |
| A003 | 無線網路安全 | 網管人員 | |
| A004 | 系統滲透測試與漏洞利用 | 程式開發人員、資安工程師 | |
| A005 | 內網滲透測試 | 網管人員 | |
| A006 | 數位鑑識概念及實作 | 網管人員、系統管理人員、資安鑑識人員 | |
| A007 | 軟體逆向工程 | 網管人員、軟體開發人員 | |
| A008 | 行動安全與行動APP逆向工程 | 網管人員、APP開發人員 | |
| A009 | 流量分析 | 網管人員 | |
| A010 | 記錄檔稽核 | 網管人員 | |
| A011 | 資安事故回應與處理 | 網管人員、系統管理人員 | |
| A012 | 資料保護 | 資安人員 | |
| A013 | 威脅情報分析 | 資安人員網管人員 | |
| A014 | APP 安全 | 資安研究員 | |
| A015 | 進階網頁滲透測試 | 資安人員、網管人員、網頁開發人員 | |
| A016 | 虛擬化技術及其資安應用 | 資安人員、軟體開發人員 | |
| 資安高階專業課程 | P001 | 漏洞開發進階篇 | 資安研究員 |
| P002 | 程式安全 | 資安研究員 | |
| P003 | 程式分析與自動化 | 資安研究員 | |
| P004 | 惡意程式行為分析與演進 | 資安研究員 | |
| P005 | 進階逆向工程 | 資安研究員 | |
| P006 | 高階網頁滲透測試 | 網管網頁開發人員、資安人員、具網頁安全或滲透測試實務經驗者 | |
| 法律與管理 | L001 | 資安管理法解碼 | 主管決策與管理人員 |
| L002 | 資安風險管理 | 主管決策與管理人員 | |
| L003 | 資安作業流程與管理 | 主管決策與管理人員 | |
| L004 | 個資法 | 主管決策與管理人員 | |
| L005 | 企業資安決策與管理 | 高階主管、決策與管理人員 |